Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMARCD1Q96GM5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMARCD1Q96GM5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms