Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms