Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCE1Q969G3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCE1Q969G3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms