Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHMTQ93088 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHMTQ93088 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms