Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A3Q93084 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms