Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

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Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRUQ92729 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRUQ92729 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
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PTPRUQ92729 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
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PTPRUQ92729 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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PTPRUQ92729 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRUQ92729 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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