Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABGGTAQ92696 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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