Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms