Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSPC1Q8WXF1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSPC1Q8WXF1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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