Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMO7Q8WWI1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMO7Q8WWI1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms