Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms