Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCAF4Q8WV16 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DCAF4Q8WV16 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms