Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MYRIPQ8NFW9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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