Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms