Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LINC00612Q8N6U2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC00612Q8N6U2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms