Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms