Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37DQ86XT2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37DQ86XT2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms