Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKAP1Q86WV1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms