Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD163Q86VB7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms