Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PBRM1Q86U86 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PBRM1Q86U86 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms