Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00523Q86TU6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00523Q86TU6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms