Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
YTHDF3Q7Z739 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms