Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRGAP1Q7Z6B7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms