Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMC6Q7Z403 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC6Q7Z403 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms