Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAXIP1Q6ZW49 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXIP1Q6ZW49 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms