Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00299Q6ZSB3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms