Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SUSD1Q6UWL2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SUSD1Q6UWL2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms