Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A10Q6U841 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms