Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF7Q6Q0C0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF7Q6Q0C0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms