Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC27A1Q6PCB7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC27A1Q6PCB7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms