Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.336e-10■■■■■ 39.4
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PRPF8Q6P2Q9 TSSC4-204ENST00000435795 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.8□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-10■■■■■ 39.2
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PRPF8Q6P2Q9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 39.2
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PRPF8Q6P2Q9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-10■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 ABI2-207ENST00000413635 515 ntTSL 412.43□□□□□ -0.426e-20■■■■■ 39.2
PRPF8Q6P2Q9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 39.2
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