Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRNP1Q6NT89 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNP1Q6NT89 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms