Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC70Q6NSX1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC70Q6NSX1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms