Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CARMIL2Q6F5E8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms