Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMO4Q6EEV6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SUMO4Q6EEV6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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