Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD40Q6AI12 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms