Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E4F1Q66K89 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E4F1Q66K89 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms