Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR78Q5VTH9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms