Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RNF220Q5VTB9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RNF220Q5VTB9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms