Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC01545Q5VT33 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms