Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOGA3Q5TF21 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOGA3Q5TF21 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms