Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC183Q5T5S1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC183Q5T5S1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms