Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CELF3Q5SZQ8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CELF3Q5SZQ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms