Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSL3PQ5NE16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSL3PQ5NE16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms