Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HABP4Q5JVS0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HABP4Q5JVS0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms