Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms