Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC178Q5BJE1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC178Q5BJE1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms