Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC153Q494R4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms