Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BBS9Q3SYG4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms