Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms